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http://cimat.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1008/995| Modelo estadístico para la asignación de ARNs pequeños, en el contexto deinteracción huésped-parásito | |
| GILBERTO FLORES VARGAS | |
| Acceso Abierto | |
| Atribución-NoComercial | |
| Modelación Clasificación | |
| El presente proyecto ha sido motivado por la colaboracion con el grupo de Genómica Computacional del ARN del Laboratorio Nacional de Genomica para la Biodiversidad (LANGEBIO). El problema biologico de fondo abordado es un problema de frontera en dicho contexto y hasta el momento no existe un modelo probabilístico con el enfoque del desarrollado en esta tesis. Específicamente, en la tesis se postula un modelo probabilístico ad hoc que permite resolver el problema de asignación de lecturas de secuencias cortas de ARN, en el contexto de interaccion entre un huésped y un parásito. Dicho problema consiste en discernir la procedencia específica de las lecturas entre varios posibles precursores. Por su parte, la solución se presenta en términos formales de probabilidad y estadística. Respecto al modelo de probabilidad desarrollado, este aporta una nueva metodología, y está basado en modelos de abundancia de especies, algo que se ha considerado poco en el contexto de genética. Para plantearlo se hace uso de la terminología existente en el contexto de modelos gráficos de probabilidad. Destaca que el numero de parámetros considerados es menor al de modelos previos relacionados. Así mismo, se desarrolla un esquema que permite resolver el problema implícito de clasificación. El esquema se basa en la aplicación de una variante del algoritmo EM: versión estocástica de EM. | |
| 01-08-2019 | |
| Tesis de maestría | |
| PROBABILIDAD | |
| Versión aceptada | |
| acceptedVersion - Versión aceptada | |
| Aparece en las colecciones: | Tesis del CIMAT |
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